Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pax7P47239 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pax7P47239 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pax7P47239 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms