Protein–RNA interactions for Protein: P43345

Tlx1, T-cell leukemia homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx1P43345 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlx1P43345 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlx1P43345 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms