Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
NodalP43021 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
NodalP43021 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
NodalP43021 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
NodalP43021 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NodalP43021 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NodalP43021 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
NodalP43021 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
NodalP43021 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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