Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Rpl28P41105 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
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