Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cd9P40240 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms