Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Traf1P39428 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Traf1P39428 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms