Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PpargP37238 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpargP37238 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpargP37238 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpargP37238 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpargP37238 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PpargP37238 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PpargP37238 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PpargP37238 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PpargP37238 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms