Protein–RNA interactions for Protein: P35438

Grin1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin1P35438 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grin1P35438 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grin1P35438 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grin1P35438 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms