Protein–RNA interactions for Protein: P35292

Rab17, Ras-related protein Rab-17, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab17P35292 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rab17P35292 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rab17P35292 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms