Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab23P35288 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab23P35288 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab23P35288 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rab23P35288 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rab23P35288 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rab23P35288 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms