Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ptk2P34152 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ptk2P34152 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms