Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxc10P31257 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Hoxc10P31257 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms