Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 1700003C15Rik-202ENSMUST00000188236 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxa2P31245 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxa2P31245 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms