Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Msr1P30204 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Msr1P30204 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms