Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RxrgP28705 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RxrgP28705 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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