Protein–RNA interactions for Protein: P28028

Braf, Serine/threonine-protein kinase B-raf, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrafP28028 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BrafP28028 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BrafP28028 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BrafP28028 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BrafP28028 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms