Protein–RNA interactions for Protein: P27790

Cenpb, Major centromere autoantigen B, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpbP27790 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CenpbP27790 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms