Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Cd40lgP27548 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cd40lgP27548 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms