Protein–RNA interactions for Protein: P25119

Tnfrsf1b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf1bP25119 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnfrsf1bP25119 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tnfrsf1bP25119 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms