Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk11bP24788 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk11bP24788 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms