Protein–RNA interactions for Protein: P24161

Cd247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd247P24161 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cd247P24161 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms