Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SftpcP21841 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SftpcP21841 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SftpcP21841 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SftpcP21841 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SftpcP21841 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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