Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klra1P20937 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klra1P20937 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Klra1P20937 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Klra1P20937 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms