Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P20040 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P20040 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P20040 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P20040 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P20040 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P20040 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P20040 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P20040 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P20040 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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