Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
P18529 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
P18529 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
P18529 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18529 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18529 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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