Protein–RNA interactions for Protein: P17095

Hmga1, High mobility group protein HMG-I/HMG-Y, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmga1P17095 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hmga1P17095 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hmga1P17095 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms