Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Dnmt1P13864 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Dnmt1P13864 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnmt1P13864 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnmt1P13864 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Dnmt1P13864 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms