Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DmdP11531 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DmdP11531 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
DmdP11531 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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DmdP11531 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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DmdP11531 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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DmdP11531 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DmdP11531 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DmdP11531 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DmdP11531 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms