Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Fv4P11370 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms