Protein–RNA interactions for Protein: P10711

Tcea1, Transcription elongation factor A protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea1P10711 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tcea1P10711 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tcea1P10711 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms