Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Hoxd4P10628 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Hoxd4P10628 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms