Protein–RNA interactions for Protein: P10287

Cdh3, Cadherin-3, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh3P10287 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cdh3P10287 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cdh3P10287 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms