Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Schip1P0DPB4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms