Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Amd1P0DMN7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms