Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc8P09025 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms