Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxb7P09024 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxb7P09024 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxb7P09024 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms