Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Apoa4P06728 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Apoa4P06728 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms