Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P04213 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P04213 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P04213 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P04213 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P04213 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms