Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01735 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01735 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01735 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01735 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01735 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01735 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms