Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
P01629 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P01629 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P01629 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P01629 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01629 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms