Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sypl2O89104 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl2O89104 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl2O89104 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl2O89104 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sypl2O89104 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms