Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lnx1O70263 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Lnx1O70263 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lnx1O70263 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
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