Protein–RNA interactions for Protein: O70238

Rhox6, Homeobox protein PSX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox6O70238 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rhox6O70238 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rhox6O70238 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rhox6O70238 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms