Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cd70O55237 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms