Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Ptpn20O55082 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptpn20O55082 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptpn20O55082 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms