Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
NlkO54949 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
NlkO54949 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
NlkO54949 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NlkO54949 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
NlkO54949 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NlkO54949 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
NlkO54949 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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