Protein–RNA interactions for Protein: O35988

Sdc4, Syndecan-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sdc4O35988 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sdc4O35988 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Sdc4O35988 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sdc4O35988 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sdc4O35988 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sdc4O35988 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sdc4O35988 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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