Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk5r2O35926 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk5r2O35926 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms