Protein–RNA interactions for Protein: O35654

Pold2, DNA polymerase delta subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold2O35654 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pold2O35654 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pold2O35654 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms