Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6aO35464 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6aO35464 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms